MGISEQ-2000通量灵活，每次运行支持1~2张载片同时上机，支持不同规格的载片（FCS小载片、FCL大载片）独立运行，支持多种测序读长，能够全面满足广泛的测序需求，是大中型测序实验室的首选机型之一。

MGISEQ-200是一款小巧灵活的桌面型基因测序仪，提供不同硬件配置选择，以适配不同的应用场景及多元化的预算要求。 MGISEQ-200提供不同规格的载片及配套试剂套装， 满足数据产出在10 Gb~150 Gb范围内的应用需求，包括低深度全基因组测序、靶向捕获/多重测序、小型基因组测序、RNA测序、全外显子组测序等。